(５)微生態平衡問題 畜禽腸道中存在大量的微生物，它們是畜禽在與外界環境，飼料、飲水等接觸過程中逐漸形成的，根據它們對畜禽生產所造成的影響，可以大體將腸道微生物分為有益菌群和其它條件型細菌兩類。目前大量的研究結果證明，有益菌群如乳酸桿菌，雙歧桿菌可以促進宿主腸壁組織結構的發育，分解抗營養因子，增加某些營養物質的消化利用率，通過營養與空間的競爭，形成優勢菌群抑制有害菌的繁殖與生長。正常情況下，腸道菌群在數量，種類以及定植部位上保持平衡，當該種平衡遭到破壞時，就會抑制畜禽的生長，使動物對疾病敏感。抗生素特別是廣譜性抗生素，在殺滅病原菌的同時，也將抑殺對人類和動物胃腸道的有益菌群，造成機體內菌群失調，從而誘發消化功能紊亂。