黃曲霉毒素可能算是最受關注的霉菌毒素了，因為它對人類和動物都構成健康威脅。由于黃曲霉毒素可在肉品當中積累，因此這是一個不容忽視的公共健康問題。為了杜絕豬肉產品出現黃曲霉問題，商品豬飼料當中的黃曲霉毒素含量不得超過20ppb（十億分之一）。
嘔吐毒素，或稱DON（脫氧雪腐鐮孢菌烯醇），在飼料中含量1至3ppm時，會降低采食量和增重速度，年輕豬只最易受影響。牛和家禽對嘔吐毒素的耐受力遠高于豬。DON常常與另外一種霉菌毒素，玉米赤霉烯酮，同時出現，因為這兩種毒素是同一種霉菌產生的。
伏馬毒素是一個家族，包括多種霉菌毒素，馬和驢對這種毒素最敏感。對于豬，建議飼料中伏馬毒素總含量要低于10ppm。
赭曲霉毒素主要影響腎臟，但同時也會對其它組織和器官造成損傷。建議豬飼料中含量低于0.2ppm。
T-2毒素不象DON那么常見，但毒性更強，會造成拒食、嘔吐以及腸道損傷。有時甚至造成死亡。對于豬，建議飼料中T-2毒素含量低于2ppm。
最后，玉米赤霉烯酮是一種類雌激素的毒素，也就是說它會模仿雌激素的效果，造成不孕、假妊娠和子宮脫垂。仔豬飼料當中的含量應低于1ppm，生長豬應低于3ppm。
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