三種抗菌肽的結構具有不同的特點，因而有不同的抗菌機理。三種抗菌肽對G-菌的細胞壁的作用有濃度依賴性，而對G+的金黃色葡萄球菌在較低的濃度時即可發生作用。MDL-2和MDL-3與金黃色葡萄球菌的細胞膜作用曲線呈現典型的S型，存在較強的協同效應，推測可能符合可變“毯”模型作用機制。抗菌肽不僅與細菌的細胞壁、細胞膜作用形成孔道，而且導致260nm的紫外吸收物如DNA、RNA等泄漏，加速細菌的死亡。進一步采用熒光光譜法分析，抗菌肽可能首先與細菌DNA骨架的磷酸基團通過靜電引力結合，使DNA的空間結構發生變化，抗菌肽進一步與DNA雙螺旋的溝槽結合，然后抗菌肽以嵌入或部分嵌入方式與DNA相互作用，影響DNA的復制、轉錄和表達功能，從根本上對細菌的生長、繁殖起到抑制作用。
總之，本研究通過對家蠅幼蟲的誘導后，分離純化得到三種抗菌肽，同時建立了電泳制備和回收抗菌肽方法，檢測了抗菌肽的物化性質，分析了構效關系和抗生素的協同作用，并且應用細胞學、生物化學和分子生物學的方法研究了抗菌肽通過與細菌內、外膜作用后影響細菌的代謝，并進一步與細菌DNA結合的抗菌機理。